MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii BJAB0868 plasmid p3BJAB0868

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021732	ATG	2	6	32	37	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021732	GAT	2	6	96	101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021732	CAC	2	6	110	115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021732	AT	3	6	143	148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021732	CAT	2	6	149	154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021732	TAGT	2	8	1018	1025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021732	GGT	2	6	1086	1091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021732	ATC	2	6	1101	1106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021732	CAT	2	6	1165	1170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021732	GCTG	2	8	1231	1238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021732	TC	3	6	1444	1449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021732	CGT	2	6	1454	1459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021732	CAA	2	6	1498	1503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021732	GAA	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021732	TCA	2	6	1530	1535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021732	CG	3	6	1562	1567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021732	TGCTC	2	10	1570	1579	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_021732	AAC	2	6	1634	1639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021732	CCA	2	6	1719	1724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021732	T	7	7	2700	2706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021732	AGC	2	6	2732	2737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021732	AGC	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021732	GCC	2	6	3459	3464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021732	ATTC	2	8	4146	4153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021732	CGC	2	6	4161	4166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021732	CGC	2	6	5017	5022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021732	CGCGG	2	10	5025	5034	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_021732	TAT	2	6	5105	5110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021732	ATA	2	6	5123	5128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021732	AT	3	6	5149	5154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021732	GGCT	2	8	5162	5169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021732	CCG	2	6	5253	5258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021732	ATTTT	2	10	5284	5293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021732	ATCC	2	8	5311	5318	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021732	CGT	2	6	5356	5361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021732	TGC	2	6	5440	5445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021732	GCC	2	6	6350	6355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_021732	GTT	2	6	6376	6381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021732	TG	3	6	6426	6431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021732	CGA	2	6	6483	6488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021732	CCG	2	6	6506	6511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021732	TGG	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021732	AAC	2	6	6625	6630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021732	GGA	2	6	6730	6735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021732	TC	3	6	8347	8352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021732	TTA	2	6	8391	8396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021732	GAG	2	6	8480	8485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021732	GGT	2	6	8492	8497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021732	CAA	2	6	9402	9407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021732	CTT	2	6	9523	9528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021732	GTT	2	6	9564	9569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021732	AT	4	8	10539	10546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021732	TTA	3	9	10613	10621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021732	ACA	2	6	10703	10708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021732	ATGC	2	8	10767	10774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021732	TTC	2	6	10819	10824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021732	TCATT	2	10	10838	10847	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021732	T	6	6	10846	10851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021732	T	6	6	10865	10870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021732	ACA	2	6	10921	10926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021732	CTGAT	2	10	11134	11143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021732	CTT	2	6	12399	12404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021732	ATTTT	2	10	12432	12441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021732	T	6	6	12438	12443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021732	TGG	2	6	12513	12518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021732	TGT	2	6	12524	12529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021732	AT	3	6	12540	12545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021732	AT	3	6	12550	12555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021732	AAAGTA	2	12	12556	12567	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021732	T	9	9	12655	12663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021732	GGA	2	6	12665	12670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021732	TGC	2	6	12710	12715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021732	A	6	6	12718	12723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021732	TAAA	2	8	12744	12751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021732	ATTA	2	8	14251	14258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021732	TTGG	2	8	15209	15216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021732	ATT	2	6	15387	15392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021732	TAA	2	6	15443	15448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021732	CAT	2	6	15450	15455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021732	T	6	6	15460	15465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021732	GAG	2	6	15466	15471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021732	ATT	2	6	15474	15479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021732	GAG	2	6	15622	15627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021732	CCGA	2	8	15658	15665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021732	TAAG	2	8	15768	15775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021732	ACCA	2	8	15782	15789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021732	TG	3	6	18169	18174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021732	GATT	2	8	18218	18225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021732	TC	3	6	18227	18232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021732	ATTG	2	8	18314	18321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021732	TTGA	2	8	18325	18332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021732	T	8	8	18343	18350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021732	AT	3	6	18436	18441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021732	T	6	6	18490	18495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021732	TTAAC	2	10	18538	18547	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.